O nouă cercetare constată că SARS-CoV-2 (Virusul care cauzează COVID-19) înotează lilieci pentru persoanele cu schimbări mici

O schemă a istoriei noastre evolutive propuse a cladei nCoV și a presupuselor evenimente care au dus la apariția SARS-CoV-2. Credit: MacLean OA și colab. (2021), Selecția naturală în evoluția SARS-CoV-2 la lilieci a creat un virus universal și un agent patogen uman puternic. PLoS Biol 19 (3): e3001115. CC-BY

Câți au făcut SARS-CoV-2 ai nevoie de o schimbare pentru a te adapta la noua sa gazdă umană? Într-un articol de cercetare publicat în jurnalul cu acces liber PLOS Biology Oscar MacLean, Spyros Lytras în Universitatea din Glasgow, și colegii săi, arată că, din decembrie 2019 și în primele 11 luni ale pandemiei SARS-CoV-2, s-au înregistrat modificări genetice „foarte importante” în sutele și mii de genomi de viruși în ordine.

Studiul este o colaborare între cercetători din Marea Britanie, SUA și Belgia. Autorii principali, profesorul David L Robertson (la Centrul de cercetare a virusului MRC-Universitatea din Glasgow, Scoția) și profesorul Sergei Pond (la Institutul de Genomică și Medicină Evolutivă, Universitatea Temple, Philadelphia) și-au transformat cu succes experiența în analiza datelor. de la HIV și alte virusuri la SARS-CoV-2. Cadrul analitic de ultimă oră al lui Pond, HyPhy, a fost esențial în tachinarea semnăturilor de evoluție încorporate în genomii virusului și se bazează pe decenii de cunoștințe teoretice asupra proceselor de evoluție moleculară.

Primul autor explică Oscar MacLean, „Acest lucru nu înseamnă că nu au avut loc modificări, mutații fără nicio semnificație evolutivă se acumulează și„ navighează ”de-a lungul a milioane de evenimente de transmitere, așa cum se întâmplă în fiecare virus.” Unele modificări pot avea un efect; de exemplu, înlocuirea Spike D614G care sa dovedit a spori transmisibilitatea și alte modificări ale biologiei virusurilor împrăștiate pe genomul său, cu toate acestea, în cea mai mare parte, au dominat procesele evolutive „neutre”. „Această stază este atribuită naturii extrem de sensibile a populația umană la acest nou agent patogen, cu presiune limitată din partea imunității populației și lipsa de izolare, ceea ce duce la o creștere exponențială, ceea ce face ca aproape toți virușii să fie câștigători. “

Pool comentează, „ceea ce a fost atât de surprinzător este cât de transferabil a fost SARS-CoV-2 de la început. Virușii care intră într-o nouă specie gazdă necesită, de obicei, ceva timp pentru a dobândi adaptări pentru a fi la fel de capabili ca SARS-CoV-2 în răspândire și majoritatea nu reușesc niciodată să treacă de acea etapă, ducând la revărsări în impas sau focare locale. ”

În studierea proceselor mutaționale ale SARS-CoV-2 și ale sarbecovirusurilor asociate (grupul virusurilor SARS-CoV-2 aparțin liliecilor și pangolinelor), autorii au găsit dovezi ale unei schimbări destul de semnificative, dar toate acestea înainte de apariția SARS-CoV- 2 la oameni. Acest lucru înseamnă că natura „generală” a multor coronavirusuri și facilitatea lor aparentă de a sări între gazde, a perfuzat SARS-CoV-2 cu capacitatea pregătită de a infecta oamenii și alte mamifere, dar cea care a evoluat la lilieci înainte de a fi transferată la oameni. .

Spyros Lytras, primul autor comun și doctorand, a adăugat: „Interesant este că unul dintre cei mai apropiați virusuri de lilieci, RmYN02, are o structură genomică interesantă, care include segmente SARS-CoV-2 și virusuri de liliac. Materialul său genetic are două semnături compoziționale distincte (asociate cu acțiunea imună antivirală a gazdei), susținând această schimbare a vitezei evolutive care a avut loc la lilieci fără a fi nevoie de o specie de animal intermediară. “

Robertson spune, „motivul pentru care SARS-CoV-2„ schimbă vitezele ”în ceea ce privește rata sa mai mare de evoluție la sfârșitul anului 2020, asociată cu descendențe mutante mai grele, se datorează faptului că profilul imunologic al populației umane s-a schimbat. „Virusul spre sfârșitul anului 2020 a fost din ce în ce mai expus la imunitatea actuală a gazdei, deoarece numărul persoanelor infectate anterior era acum ridicat. Aceasta va selecta pentru variantele care pot ocoli o parte din răspunsul gazdei. Împreună cu evaziunea imună în infecțiile pe termen lung în cazurile cronice (de exemplu, la pacienții cu imunitate severă), aceste noi presiuni selective măresc numărul de mutații importante.

Este important de apreciat că SARS-CoV-2 este încă un virus acut, eliminat de răspunsul imun în marea majoritate a infecțiilor. Cu toate acestea, acum se îndepărtează mai repede de varianta din ianuarie 2020 utilizată în toate vaccinurile actuale pentru a crește imunitatea de protecție. Vaccinurile actuale vor continua să acționeze împotriva majorității variantelor circulante, dar cu cât trece mai mult timp și cu cât este mai mare diferența dintre numărul de persoane vaccinate și fără vaccinare, cu atât sunt mai mari șansele de a scăpa de vaccin. Robertson a adăugat: „Prima cursă a fost dezvoltarea unui vaccin. Cursa acum este de a vaccina populația globală cât mai curând posibil. ”

Referință: „Selecția naturală în evoluția SARS-CoV-2 la lilieci a creat un virus universal și un agent patogen uman foarte puternic” de Oscar A. MacLean, Spyros Lytras,
Steven Weaver, Joshua B. Singer, Maciej F. Boni, Philippe Lemey, Sergei L. Kosakovsky Pond și David L. Robertson, 12 martie 2021, PLOS Biology.
DOI: 10.1371 / journal.pbio.3001115

Finanțare: DLR este finanțat de Consiliul de cercetare medicală (MC_UU_1201412) și Wellcome Trust (220977 / Z / 20 / Z). OAM este finanțat de Wellcome Trust (206369 / Z / 17 / Z). SLKP și SW sunt susținute în parte de Institutele Naționale de Sănătate (R01 AI134384 (NIH / NIAID)) și Fundația Națională pentru Științe (premiul 2027196). PL recunoaște finanțarea din partea Consiliului European de Cercetare în cadrul programului de cercetare și inovare al Uniunii Europene Horizon 2020 (acordul de finanțare numărul 725422-ReservoirDOCS), proiectul MOOD (874850) al proiectului UE Horizon 2020, Wellcome Trust prin proiectul 206298 / Z / 17 / Z (The Artic Network) și Institutul de cercetare – Flandra („Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek – Vlaanderen”, G066215N, G0D5117N și G0B9317N). MFB este finanțat printr-o subvenție din partea Fundației Bill și Melinda Gates (INV-005517) și de contractul Centrului de excelență NIH / NIAID în cercetarea și supravegherea gripei (HHS N272201400007C). Finanțatorii nu au avut niciun rol în proiectarea studiului, colectarea și analiza datelor, decizia de publicare sau pregătirea manuscriselor.

Related articles

Comments

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here

Share article

Latest articles

Nanofibrele centrifugale multifuncționale pun un nou efect asupra măștilor COVID-19

Figura (A) Ilustrația schematică a procesului de producție a nanofibrelor polimerului centrifug polimer multispinning. (B) Nanofibrele polimerice sunt rotite de sistem. O...

Arheologii găsesc dovezi din monumentele de câini domestici din Peninsula Arabică Antică

Situat în regiunea tărâmurilor Alula, în nord-vestul Arabiei Saudite, acest cimitir este acum rar construit pe pământ pentru Arabia Neolitică-Calcolitică și este un ajutor...

Pe măsură ce straturile de gheață s-au topit, nivelul mării a crescut până la 18 metri

Se știe că creșterea nivelului mării datorită schimbărilor climatice este o amenințare majoră. Noile cercetări au arătat că evenimentele anterioare de pierdere a...

Oamenii de știință identifică genele umane care luptă împotriva infecției cu SARS-CoV-2

Vedere microscopică a coronavirusului. Credit: Yeti punctat Cercetările indică controlul genelor care stimulează interferonul SARS-CoV-2 Copie Oamenii de știință de la Sanford Burnham Prebis au...

Noua tehnică „Mașina timpului” dezvăluită pentru măsurarea celulei

Celulele dendritice (roșii / verzi co-colorate) într-un folicul limfoid (fragment de peyer) drenează intestinul (albastru). Credit: Wang Cao și Shengbo Zhang, WEHI Utilizând o...

Newsletter

Subscribe to stay updated.