Rezolvarea misterului genetic din centrul epidemiei COVID-19

Această imagine cu microscop electronic cu scanare arată barza-covy-2 care se ridică de la suprafața celulelor cultivate (albastru / roz) în laborator 2 credite: Institutul Național de Alergii și Boli Infecțioase-Laboratoarele Rocky Mountain, NIH

Biologii calitativi au descoperit sursa unei singure proteine ​​unice SARS-CoV-2 Clan

La fel de COVID-19 Pe măsură ce pandemia intră în al doilea an, oamenii de știință încă lucrează pentru a înțelege cum a evoluat tulpina SARS-CoV-2 și cum a devenit atât de periculos decât alte coronavirusuri în care oamenii trăiesc de milenii.

Virologii și epidemiologii din întreaga lume au speculat de luni de zile că o proteină numită ORF8 conține probabil răspunsul, iar un studiu recent al oamenilor de știință din Berkeley Lab a contribuit la confirmarea acestei ipoteze.

Publicat într-o lucrare de cercetare MBO, Autor principal Russell Neches și colegii săi arată că ORF8 a evoluat dintr-o altă proteină coronavirus numită ORF7a și că ambele proteine ​​sunt pliate ca anticorpii umani. Această constatare ajută la explicarea modului în care rezistența la virus evită detectarea și poate duce la o infecție gravă la unele gazde.

„Prin explorarea caracteristicilor structurale și funcționale ale ORF8 și folosirea supercomputerelor pentru a analiza genomurile a peste 200.000 de viruși, am descoperit o tehnică evolutivă interesantă și extrem de neobișnuită”, a declarat Nikos Crippides, un biolog important co-autor al articulației DRE Joint Genomul. “Surprinzător, se pare că în interiorul berii îmbrăcate, gena care codifică ORF7 este utilizată ca genă șablon, rămâne stabilă, un duplicat al acestei gene se dezvoltă aproape dincolo de recunoaștere.” SARS-CoV-2 apare și explodează într-o epidemie atunci când gena falsă ORF7a a unei tulpini de barză este transformată într-o nouă proteină (numită acum ORF8) care îi permite să interfereze cu celulele imune.

Potrivit echipei, un incident similar s-a produs în tulpina de barză-COV care a provocat epidemia de barză la începutul anilor 2000. În această situație, o copie a genei ORF7a se împarte în două, rezultând proteinele ORF8a și ORF8b.

Christos Ozunis, autor principal al studiului și om de știință asociat la JGI, a remarcat că legătura dintre ORF7 și ORF7A a fost inițial destul de dificilă, deoarece se știa puțin despre acest set de gene și proteinele codificate ale acestora. Proteinele de suprafață (cum ar fi infamele proteine ​​spike) și deoarece ORF8 și ORF7a par acum să fie diferite de inundații. ORF7a este o proteină extrem de stabilă, rezistentă la mutații, care interacționează cu foarte puține proteine ​​din stratul de mamifere, unde majoritatea genelor predispuse la mutație din genomul viral ORF8 sunt codificate și sunt acum cunoscute a fi implicate în zeci de interacțiuni în corpul uman.

„Descoperirile noastre – și confirmarea lor prin secvențe paralele și studii structurale – arată că ORF 8K este un punct fierbinte evolutiv al familiei de barza. Lipsa cunoștințelor despre rolul acestor gene a mutat accentul pe o mai bună înțelegere a genelor, dar acum știm mai multe despre aceste gene și sperăm că va primi mai multă atenție din partea comunității ”, a spus Kirpides.

Referință: „Divergența atipică a SARS-Cowi-2 Orf 8 din Orf 7A din genul Cornavirus sugerează posibile strategii virale sigure pentru furt imun” Russell Y. Natches, Nikos C. Criptide și Christos la Eugene, 19 ianuarie 2021, MBO.
DOI: 10.1128 / MBO.03014-20

Această lucrare a fost susținută de proiectul Xbaum colaborativ condus de Berkeley Lab, care a dezvoltat echipamente de supercomputere pentru analiza microbiomului. JGI este biroul de știință al utilizatorului.

Related articles

Comments

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here

Share article

Latest articles

Nanofibrele centrifugale multifuncționale pun un nou efect asupra măștilor COVID-19

Figura (A) Ilustrația schematică a procesului de producție a nanofibrelor polimerului centrifug polimer multispinning. (B) Nanofibrele polimerice sunt rotite de sistem. O...

Arheologii găsesc dovezi din monumentele de câini domestici din Peninsula Arabică Antică

Situat în regiunea tărâmurilor Alula, în nord-vestul Arabiei Saudite, acest cimitir este acum rar construit pe pământ pentru Arabia Neolitică-Calcolitică și este un ajutor...

Pe măsură ce straturile de gheață s-au topit, nivelul mării a crescut până la 18 metri

Se știe că creșterea nivelului mării datorită schimbărilor climatice este o amenințare majoră. Noile cercetări au arătat că evenimentele anterioare de pierdere a...

Oamenii de știință identifică genele umane care luptă împotriva infecției cu SARS-CoV-2

Vedere microscopică a coronavirusului. Credit: Yeti punctat Cercetările indică controlul genelor care stimulează interferonul SARS-CoV-2 Copie Oamenii de știință de la Sanford Burnham Prebis au...

Noua tehnică „Mașina timpului” dezvăluită pentru măsurarea celulei

Celulele dendritice (roșii / verzi co-colorate) într-un folicul limfoid (fragment de peyer) drenează intestinul (albastru). Credit: Wang Cao și Shengbo Zhang, WEHI Utilizând o...

Newsletter

Subscribe to stay updated.